機的本义是木制机械结构枢纽，尤其是触发装置。“主发谓之機。”——《说文》。举例来说，木制桌椅不算機。木制弩只有触发装置算機，又分機牙、機括和機郭，这种东西精巧从外面看不到而且需要保密（华夏人不希望蛮夷学会制弩），所以有引申义“機巧”和“機密”。

《列子·汤问篇》中周穆王西巡遇偃师献神奇人偶，拿掉枢纽就不会动“试废其心，则口不能言；废其肝，则目不能视；废其肾，则足不能步。”诸葛亮的木牛流马枢纽被做手脚就不会动。北宋神臂弓“最为利器”“宋军拒金，多倚此为器。军法不得遗失一具，或败不能携,，则宁碎之，防敌得其機轮仿制也。”可见枢纽是机械的核心，尺寸不大，一旦破坏，功能丧失。生物死后就不会动了，所以古人相信活体生物体内有一种神秘存在，比喻为“生機”，这是很正常的思路。

英文organic的词根organ是器官，有机物organico来源于古希腊语organiks“与组织或器官相关的”，如果把“生物器官”比喻成“机械枢纽”，其思路跟古华夏人类似，只不过古华夏人用比喻，古希腊人没有比喻。

结论，我认为晚清同文馆总教习丁韪良在《格物入门》第6卷《化学入门》第一次将organic翻译为“有机”不是音译，而是意译。